التحور الجديد لفيروس كورونا
التحور الجديد للفيروس
هذا الفيروس مر بتحورات عديدة خلال هذه السنة، لكن!
لماذا هذا التحور بالذات الذي اثار كل هذه الفوضى؟
في هذه السلسلة بعنوان ”Mutation in depth”
نستعرض الاسباب، ولماذا كل هذه الاحترازات
تنويه:
هذه السلسلة تحليل و قراءة للمقال الاولي الصادر من الهيئة الملكية البريطانية للجينوم المختص بالكوفيد١٩ CoG-UK
والذي برأيي افضل ما كُتب الى الان!
الرابط في نهاية السلسلة !!
الفيروسات تتحور دائماً وهذه ليس بمفاجئة،
وكان متوقع حدوثه وقد حدث بالفعل عندما انتشر من الصين في فبراير D614G والذي اصبح السائد في اوربا
لكن هذا التحور شمل ١٧ تحوراً مرة واحدة، وقد تم اكتشافه في شهر ٩
ومع ازدياد الحالات و تهرب الفايروس من بعض الاجسام المضادة
تم الاعلان عنه
هذه التحورات ال١٧ اغلبها في السنبلة البروتينية ( ٨ تحورات) المسؤولة عن دخول الفايروس للخلية..
بعضها مهم وبعضها أقل أهمية
بعضها من صالح الفيروس وبعضها من صالحنا
سنستعرض هنا المهم فقط وهم ثلاث تحورات
التحور الاول N501Y:
الذي اثار قلق العلماء هو تغير في السنبلة البروتينية في منطقة الReceptor Binding Domain
والسبب ان هذه المنطقة هي نقطة ارتباط الفايروس بالخلية، وايضا هذه هي المنطقة التي نصنع من أجلها عقار الاجسام المضادة المونوكلونال!
واذا تغيرت هذه المنطقة فمن الممكن..
ان عقار الاجسام المضادة لا يتعرف على هذا التحور ومن هذا المنطلق كان القلق المصاحب مع إعلان هذه "المتغيرة"
لكن في حالة N501Y كان:
زيادة قابلية الارتباط بالخلية، مما يجعله يلتصق بالمفاتيح البروتينية ACE2 بسهولة اكثر من سابقه وبالتالي ينتشر اسرع حتى لو كان بكمية قليلة
معلومة سريعة لماذا يسمى N501Y
N=Aspargine
حصل في الحمض الاميني رقم 501
تحول الى
Y=Tyrosine
لذلك اسمه N501Y
التحور الثاني المقلق:
هو طفرة حذفية (Deletion mutation)
في الحمض الاميني رقم ٧٠ و ٦٩
من ٣٠٠٠ الاف حمض اميني أُزيل فقط حمضين أمينيين!
وبالمناسبة هذا نفس الطفرة التي حدثت في حيوان المنك، والذي ايضا اثار هلع ضناً ان التحور قفز الى الانسان!
لكن هذا ليس ما حصل،والتحور موجود منذ زمن
ماهو تأثير هذا الحذف!
اولاً تأثيره على عقار الاجسام المضادة:
لوكان اجسام المضادة المونوكلونال ترتبط في الحمض الاميني في هذه المنطقة ومكان تواجد الحذف! فإنه لن يكون فعال ويجب على الشركة اعادة تصنيعه
لكن على حد علمي لا يوجد الى الان شركة صرحت بذلك!
ثانيا تأثيره على فحص الPCR؟
قد يكون سمعتم ان هذا التحور يسبب نتيجة سلبية خاطئة، او انه لا يكتشف هذا الفيروس!
لان بعض المسحات لا تتعرف على هذه المنطقة بسبب هذا الحذف،وهذا كلام نظري فقط
لكن
عادة اغلب الPCR يغطي اكثر من منطقة من السنبلة البروتينية
وبريطانيا كانت تفحص بنفس الPCR
التحور الثالث المهم:
P681H
السنبلة البروتينية للفايروس تحتاج اذا ارتبطت بخلية الجسم الى بروتين يسهل عملية الدخول بفتح جدار الخلية مثل المقص
هذا البروتين يفعل ذلك..
تحور بحيث يسرع من عملية القص ليسهل من دخول اكبر عدد ممكن من الفيروس
هناك تحور آخر من صالحنا
هل تتذكرون كلام الحبيب @DrSafug بأن الفايروس قد يصبح اكثر ضعفا مع هذا التحور يوجد سبب علمي لهذا الكلام وهو التحور في:
ORF8-Q27
Open reading Frame رقم ٨ و محطة الايقاف رقم ٢٧
ماذا يعني ذلك؟
الحمض النووي
يتكون من شريط هذا الشريط يحتوي على شفرات جينية تصل تقريبا الى ١٣٠/١٢٧ code
بين كل شفرة وأخرى يوجد محطة توقف مرقمة، والمسافة بين الشفرتين تدعى ORF
التحور في محطة الوقوف 27 والذي ازاحها من مكانها وبالتالي المسافة في PRF8 اصبحت غير مستغلة فالبتالي اقل خطورة
تحور مشابهة حدث في سنغافورة
التحور الجديد للفيروس
هذا الفيروس مر بتحورات عديدة خلال هذه السنة، لكن!
لماذا هذا التحور بالذات الذي اثار كل هذه الفوضى؟
في هذه السلسلة بعنوان ”Mutation in depth”
نستعرض الاسباب، ولماذا كل هذه الاحترازات
تنويه:
هذه السلسلة تحليل و قراءة للمقال الاولي الصادر من الهيئة الملكية البريطانية للجينوم المختص بالكوفيد١٩ CoG-UK
والذي برأيي افضل ما كُتب الى الان!
الرابط في نهاية السلسلة !!
الفيروسات تتحور دائماً وهذه ليس بمفاجئة،
وكان متوقع حدوثه وقد حدث بالفعل عندما انتشر من الصين في فبراير D614G والذي اصبح السائد في اوربا
لكن هذا التحور شمل ١٧ تحوراً مرة واحدة، وقد تم اكتشافه في شهر ٩
ومع ازدياد الحالات و تهرب الفايروس من بعض الاجسام المضادة
تم الاعلان عنه
هذه التحورات ال١٧ اغلبها في السنبلة البروتينية ( ٨ تحورات) المسؤولة عن دخول الفايروس للخلية..
بعضها مهم وبعضها أقل أهمية
بعضها من صالح الفيروس وبعضها من صالحنا
سنستعرض هنا المهم فقط وهم ثلاث تحورات
التحور الاول N501Y:
الذي اثار قلق العلماء هو تغير في السنبلة البروتينية في منطقة الReceptor Binding Domain
والسبب ان هذه المنطقة هي نقطة ارتباط الفايروس بالخلية، وايضا هذه هي المنطقة التي نصنع من أجلها عقار الاجسام المضادة المونوكلونال!
واذا تغيرت هذه المنطقة فمن الممكن..
ان عقار الاجسام المضادة لا يتعرف على هذا التحور ومن هذا المنطلق كان القلق المصاحب مع إعلان هذه "المتغيرة"
لكن في حالة N501Y كان:
زيادة قابلية الارتباط بالخلية، مما يجعله يلتصق بالمفاتيح البروتينية ACE2 بسهولة اكثر من سابقه وبالتالي ينتشر اسرع حتى لو كان بكمية قليلة
معلومة سريعة لماذا يسمى N501Y
N=Aspargine
حصل في الحمض الاميني رقم 501
تحول الى
Y=Tyrosine
لذلك اسمه N501Y
التحور الثاني المقلق:
هو طفرة حذفية (Deletion mutation)
في الحمض الاميني رقم ٧٠ و ٦٩
من ٣٠٠٠ الاف حمض اميني أُزيل فقط حمضين أمينيين!
وبالمناسبة هذا نفس الطفرة التي حدثت في حيوان المنك، والذي ايضا اثار هلع ضناً ان التحور قفز الى الانسان!
لكن هذا ليس ما حصل،والتحور موجود منذ زمن
ماهو تأثير هذا الحذف!
اولاً تأثيره على عقار الاجسام المضادة:
لوكان اجسام المضادة المونوكلونال ترتبط في الحمض الاميني في هذه المنطقة ومكان تواجد الحذف! فإنه لن يكون فعال ويجب على الشركة اعادة تصنيعه
لكن على حد علمي لا يوجد الى الان شركة صرحت بذلك!
ثانيا تأثيره على فحص الPCR؟
قد يكون سمعتم ان هذا التحور يسبب نتيجة سلبية خاطئة، او انه لا يكتشف هذا الفيروس!
لان بعض المسحات لا تتعرف على هذه المنطقة بسبب هذا الحذف،وهذا كلام نظري فقط
لكن
عادة اغلب الPCR يغطي اكثر من منطقة من السنبلة البروتينية
وبريطانيا كانت تفحص بنفس الPCR
التحور الثالث المهم:
P681H
السنبلة البروتينية للفايروس تحتاج اذا ارتبطت بخلية الجسم الى بروتين يسهل عملية الدخول بفتح جدار الخلية مثل المقص
هذا البروتين يفعل ذلك..
تحور بحيث يسرع من عملية القص ليسهل من دخول اكبر عدد ممكن من الفيروس
هناك تحور آخر من صالحنا
هل تتذكرون كلام الحبيب @DrSafug بأن الفايروس قد يصبح اكثر ضعفا مع هذا التحور يوجد سبب علمي لهذا الكلام وهو التحور في:
ORF8-Q27
Open reading Frame رقم ٨ و محطة الايقاف رقم ٢٧
ماذا يعني ذلك؟
الحمض النووي
يتكون من شريط هذا الشريط يحتوي على شفرات جينية تصل تقريبا الى ١٣٠/١٢٧ code
بين كل شفرة وأخرى يوجد محطة توقف مرقمة، والمسافة بين الشفرتين تدعى ORF
التحور في محطة الوقوف 27 والذي ازاحها من مكانها وبالتالي المسافة في PRF8 اصبحت غير مستغلة فالبتالي اقل خطورة
تحور مشابهة حدث في سنغافورة
